مأموریت این دفتر، تبدیل ایده‌های ناب به محصولات، خدمات و کسب‌وکارهای نوپا می باشد. این دفتر پلی میان دنیای پویای علم و پژوهش دانشگاهی و بازار پرشتاب و نیازمند نوآوری است و بستری را فراهم می‌آورد تا استعدادهای درخشان دانشگاه، شامل دانشجویان، اساتید و پژوهشگران، بتوانند توانمندی‌های خود را به منصه ظهور رسانده و نقش مؤثری در توسعه اقتصادی و فناوری کشور ایفا کنند.دفتر نوآوری و شکوفایی، با بهره‌گیری از شبکه‌ای گسترده از mentors (مربیان)، مربیان صنعتی، سرمایه‌گذاران و مراکز شتابدهی، از مرحله خلق ایده تا تجاری‌سازی و ورود به بازار، در کنار نوآوران و کارآفرینان خواهد بود. از جمله وظایف این دفتر حمایت از شکل‌گیری و رشد تیم‌های نوآور و استارتاپی، ایجاد پیوند با صنعت و بازار، پشتیبانی از ثبت مالکیت فکری و حقوقی، توسعه فضای کار اشتراکی و زیرساخت، شبکه‌سازی و ترویج فرهنگ نوآوری می باشد.